El templo se consagró en el año 1193, siendo el templo más antiguo de toda la población. Ha sufrido numerosas modificaciones con el paso de los siglos, especialmente en los siglos XV y XVI cuando se reformó la cabecera y se añadieron capillas laterales.

Interiormente está formada por dos naves, de diferente altura y divididas por unos arcos que se apoyan en un pilar cruciforme y un rectangular. Las dos naves están cubiertas con bóvedas de cañón apuntadas, que originariamente estaban reforzadas con arcos fajones, de los que quedan en pie las columnas dónde se apoyaban. Estas tienen los capiteles decorados con motivos vegetales  y alguna escena historiada. En los dos casos su traza es muy arcaica y tosca.  Los más interesantes son el que representa la Psicostasis o el pesado de las almas por parte de San Miguel i el del Pecado Original, donde vemos a Adán y Eva a los lados del Árbol Prohibido.  

Algunos estudiosos ven similitudes entre esta disposición de las naves y las de la iglesia inferior de San Juan de la Peña. Se trata de una disposición de origen mozárabe que tenía su justificación para hacer convivir a dos comunidades diferentes: la de  los judíos conversos y la de los mozárabes.

Destaca la portalada del muro sur, formada por cuatro arcos de medio punto en gradación.

Los arcos están esculpidos con motivos vegetales y florales de muy bella factura, similares a los de la cercana iglesia de San Juan, probablemente hecha por los mismos canteros.

En la dovela central del arco interior, encontramos pintada una flor de cuatro pétalos.

Actualmente alberga el museo de arte sacro de la población, hecho que impide que se puedan tomar fotografías de su interior. Como en el resto de la diócesis, el argumento del obispado es que la toma de fotografías y el hecho de colgarlas en internet favorece los robos de arte... ¿Ahora las personas que potenciamos la difusión de la cultura y el arte somos cómplices de los ladrones? Insultante...