El año 1142 este lugar ya estaba ocupado por el orden de los templarios, si bien la iglesia actual es posterior. Antiguamente era conocida como Santa Maria de los Huertos.

Originariamente fue construida con una única nave cubierta con bóveda de cañón ligeramente apuntada y reforzada con arcos torales. Posteriormente se añadió una segunda nave en el lado norte, con la bóveda claramente apuntada. Las dos naves están separadas por unos pilares hexagonales.

El ábside de la primera nave tiene forma circular, mientras que el de la segunda tiene forma poligonal por la  parte exterior. En los dos podemos observar canecillos, algunos de los cuales están esculpidos con cabezas de animales y monstruos.

Después de la expulsión de los templarios en el año 1312, el orden de San Juan de Jerusalén se hizo cargo del templo en el año 1443. Pocos años más tarde, concretamente en 1469 se abrió un hospital para asistir a los peregrinos que viajaban hacia Compostela.

Se accede al templo por una puerta situada en el lado meridional. En ella podemos ver tres pares de columnas con los fustes y los capiteles finamente decorados, que sustentan tres arquivoltas apuntadas, también decoradas. También podemos encontrar abundante decoración en los arcos que protegen las arquivoltas, principalmente motivos vegetales y entrelazados geométricos. En la arquivolta más exterior podemos encontrar figuras humanas, aves, bestias, ángeles, ...

Un pasillo con una bóveda de crucería sobre la portalada, comunica la iglesia con el hospital.

Sobre la primera nave se levanta un campanario de torre, iniciado en época medieval pero coronado en el siglo XVII.

En el interior del templo podemos encontrar varias piezas muy interesantes. Destacan la talla románica de Nuestra Señora de los Huertos, que dio nombre al templo en sus inicios y un Cristo en la Cruz del siglo XIV. Destaca por su realismo y por la exagerada expresión de dolor. La imagen gótica está clavada en una cruz en forma de Y.

La desamortización de 1835 provocó el abandono del conjunto conventual y su consecuente degradación. En el año 1919 volvió a ser habitado por una comunidad religiosa y posteriormente se restauraron todos los edificios.