El templo de San Esteban se inició en el siglo XI por la zona de la cripta y del paso subterráneo. Son las partes más antiguas y por lo tanto allí donde el románico presenta unas trazas más arcaicas. Un siglo más tarde se inició el resto del templo, que se acabó en época gótica y que posteriormente recibió algunas ampliaciones, que han dejado oculta la fábrica románica. 

El templo está formato por tres naves acabadas en ábsides semicirculares. Estos se encuentran justo encima de la Cripta del Perdón. Esto hace que exteriormente  se observen tres alargados ábsides reforzados por gruesos contrafuertes, que se adelgazan algo en el tramo correspondiente a la iglesia superior. También se adelgaza ligeramente el diámetro de los ábsides.

En el exterior, a los pies del ábside, podemos encontrar una pequeña tumba antropomórfica excavada en la roca. Por sus dimensiones es probable que corresponda al enterramiento de un niño.

En la parte correspondiente a la iglesia superior se abren los ventanales que iluminan el presbiterio. Hay una ventana en cada uno de los ábsides laterales y tres en el principal. Estas están decoradas con una arquivolta esculpida, que se apoya en un par de columnas con los capiteles decorados con motivos historiados. Enmarcan los ventanales dos molduras decoradas: la inferior con motivo jaqués y la superior con otros motivos geométricos.

Los tejados reposan en una cornisa sustentada por canecillos decorados. 

Por la parte interior están decorados con unos arcos ciegos de medio punto. Los arcos del ábside central están apoyados en dobles columnas con capiteles decorados, mientras que en los laterales las columnas son simples. Estas se apoyan en una imposta decorada.  Ante el ábside principal hay un tramo de presbiterio cubierto con bóveda de cañón. El arco fajón de esta zona está apoyado en columnas adosadas con capiteles historiados. 

Las tres naves están cubiertas con bóveda de arista. El transepto, en cambio, tiene bóveda de cañón ligeramente apuntada. En el crucero volvemos a encontrar bóveda de arista con los nervios muy marcados. 

Bajo el coro construido en los pies de la nave central, encontramos una capilla dónde se puede venerar al Cristo del Perdón. Se trata de una talla románica del siglo XIII que originariamente estaba en el absidiola izquierda de la cripta.  

Otro elemento interesante conservado en este templo es la pila bautismal visigótica de ocho pétalos. En ella fue bautizado Fernando el Católico el 11 de febrero de 1453.

La portalada, muy erosionada,  está protegida por un pórtico del siglo XVI cubierto con bóveda estrellada.

Destacan las estatuas-columna, del estilo de la cercana Santa Maria de Sanguesa. Hay tres en cada lado de la puerta. Están representados de derecha a izquierda San Pelayo, la reina Estefanía, el Rey David, una imagen sin identificar que podría ser San Vicente o San Lorenzo, otro personaje con mitra y San Juan Evangelista. Entre columnas hay tres figuras sobrepuestas. En una de ellas podemos ver a San Jorge y el dragón.

La puerta está rodeada por tres arquivoltas decoradas con escenas bíblicas y mitológicas. Estas se apoyan en capiteles con decoración vegetal. En el centro encontramos un tímpano dónde hay un Pantocrátor con mandorla, rodeado por el tetramorfos, dos ángeles y una figura orando. 

Desperdigadas por la fachada podemos ver otros grupos escultóricos difíciles de identificar debido a la erosión. A duras penas se pueden observar algunos guerreros , la Visitación y la Anunciación.

Lamento muy no poder ofrecer más imágenes del interior del templo y de la cripta. Tampoco la calidad de las mismas es la deseada. Esto lo hemos de agradecer al párroco del templo. Pese a tener una autorización de la Diócesis de Jaca para fotografiar el interior de sus templos románicos, se negó a dejarme tomar imágenes o a concretar un día y hora para poderlo hacer. Finalmente accedió a que hiciera "una media docena". En un templo lleno de elementos interesantes, seis fotos no dan para nada... No pude conseguir nada más. Ni siquiera pude comprobarlas y repetirlas si habían salido mal. Fue una situación tan incómoda como incomprensible.